בן מרים ואלי. נולד ביום י"ד באדר תשכ"ז (24.2.1967) בעיר וושינגטון בארצות הברית, בעת שהות המשפחה שם עקב שליחות עיתונאית של האב, בן בכור להוריו. במלאת ליונתן (שכינוי החיבה שלו בפי בני המשפחה והחברים היה "יוני") שנתיים, שבה המשפחה לארץ אל מקום מגוריה בירושלים. יוני למד בבית-הספר היסודי 'בית הילד' והמשיך את לימודיו בבית-הספר התיכון שליד האוניברסיטה.
יוני היה ילד לבבי ובעל קסם אישי, שיצר קשרים חברתיים ענפים עם בני נוער מכל שדרות החברה. היה בעל נוכחות בולטת בכל מעגל חברתי שנקלע אליו. בזכות תכונות אלו ואחרות נבחר להשתתף בתכנית הטלוויזיה הפופולרית 'ריץ רץ'. היה בעל כושר מנהיגות טבעי ומודעות חברתית וציבורית מפותחת. היה פעיל בתנועת הצופים בשבט "מודיעין", תחילה כחניך ולאחר-מכן כמדריך וראש גדוד. יוני גדל בבית בעל זיקה לענייני ציבור ולפיכך ביקש להרחיב את ידיעותיו בהתמדה בכל הנוגע לחברה הישראלית. היו לו דעות מגובשות, שאותן נהג להשמיע בבטחה, אולם תמיד במתינות, הן מצד התוכן והן מצד הנימה. כמו-כן גילה סובלנות וכבוד לדעותיהם של אחרים כאשר היו שונות משלו. היה צעיר בעל חוש אחריות הן בחוג המשפחה וביחסו לאחיו הצעירים ממנו – שאול והלל והן בתנועה ולאחר מכן במסגרת הצבאית.
יוני התגיס לשירות בצה"ל בחודש ינואר 1986 במסגרת גרעין נח"ל, שהתכוון להתיישב בהר עמשא. עבר קורס מ"כים ופיקד על כיתת טירונים. לאחר-מכן עבר קורס קצינים, שבסיומו הדריך בבית-הספר לקצינים. בהמשך, שירת ביחידת שדה מיוחדת ולאחר קורס קציני סיור שימש כקצין מבצעים. בתום שירות החובה המשיך לשרת בצבא הקבע, והגיע לתפקיד מפקד פלוגה ביחידת השדה המיוחדת. כחבר וכמפקד התייחס בהבנה וברגישות רבה לעמיתיו ולפקודיו. הוא נטל על עצמו משימות נוספות על-מנת להקל על בעלי המשפחות ששירתו עימו במסגרת שירות המילואים שלהם, מתוך התחשבות מיוחדת בהם.
יונתן נפל בעת שירותו ביום י"ב בסיוון תש"ן (5.6.1990) והובא למנוחות בבית-העלמין הצבאי בהר-הרצל. הניח הורים ושני אחים – שאול והלל. הוא הועלה לדרגת סרן לאחר מותו.
בדברי ההספד לזכרו ציין מפקדו את ייחודו של יוני במלים "ערכיות ומצויינות".